Фамилия Ципцура — редкая, её не встретишь в списках распространённых русских фамилий. Она звучит необычно для русского уха, и это сразу подсказывает, что её корни, скорее всего, не великорусские, а юго-западные, украинские или белорусские. На это указывает и конечное -а, и отсутствие типичных русских суффиксов -ов, -ин. Скорее всего, перед нами фамилия, образованная от прозвища без добавления патронимического суффикса, то есть «застывшая» в форме именительного падежа.

Самая вероятная основа — слово «ципцур» или «ципцура». В украинских и польских говорах «ципцур» (или «цупцур») могло означать нечто маленькое, щиплющее, колкое, возможно, родственное глаголу «ципати» (щипать) или «цюпкати» (семенить, идти мелкими шажками). Прозвище Ципцура могли дать человеку маленького роста, суетливому или тому, кто имел привычку щипаться (в прямом или переносном смысле — быть придирчивым, «кусачим» на язык).

Есть и другая, более экзотическая версия, которую стоит упомянуть из-за редкости фамилии. В некоторых диалектах «ципцура» могло быть звукоподражательным прозвищем птицы, например, цыплёнка или какой-то мелкой пичуги. Тогда фамилия могла закрепиться за человеком, который разводил птицу, или за тем, кого дразнили за голос или внешность, напоминающую птицу.

Если отбросить маловероятные версии (например, тюркские корни, которые не дают убедительной фонетики), то остаётся ядро: фамилия Ципцура — типичное прозвищное образование из западнорусских земель. Носитель такой фамилии, скорее всего, происходит из крестьянской или мещанской среды, где прозвища давали по характеру, внешности или бытовой привычке. В дореволюционных метрических книгах такую фамилию логичнее всего искать на территории современной Украины (особенно Волынь, Подолье) или в южных районах Беларуси.