Фамилия Цомартов напрямую связана с осетинским мужским именем Цомарт. В дигорском диалекте осетинского языка слово «цомарт» означает «гостеприимный, щедрый». Поэтому первым носителем фамилии, скорее всего, был человек, известный своим радушием и широтой души, — такое прозвище закрепилось за ним, а затем перешло к потомкам.

Интересна география происхождения фамилии. В осетинском языке выделяют два диалекта — дигорский и иронский. Различия между ними настолько велики, что говорящие на разных диалектах часто с трудом понимают друг друга. Слово «цомарт» встречается именно в дигорском наречии, а Дигория — это историческое название территории в западной части Северной Осетии. Эта языковая деталь позволяет достаточно уверенно говорить, что основатель рода Цомартовых жил именно в Дигории.

Модель образования фамилии — классическая для русского языка, но применённая к осетинской основе. К имени Цомарт добавили типичный русский суффикс -ов, который указывает на принадлежность: «Цомартов» буквально значит «сын Цомарта» или «из семьи Цомарта». Такой способ русификации фамилий был повсеместным на Кавказе в XIX–XX веках, когда осетинские имена и прозвища адаптировались под русские официальные документы. В результате потомок человека по имени Цомарт со временем получил фамилию Цомартов.