Фамилия Цыкурин — относительно редкая, и её происхождение не лежит на поверхности. В основе, скорее всего, лежит прозвище или мирское имя, образованное от слова «цыкун». В южнорусских и украинских говорах так называли человека, который постоянно «цыкает» — то есть издает характерный звук, причмокивает, шипит или разговаривает с присвистом. Такое прозвище могли дать за манеру речи или за привычку цыкать зубом. Менее вероятна, но возможна связь с диалектным глаголом «цыкать» в значении «окликать» или «погонять» (лошадей), что могло закрепиться за возницей или конюхом.

Модель образования фамилии — патронимическая, с помощью суффикса -ин. Это один из самых распространённых русских суффиксов, указывающий на принадлежность: «чей сын?» — Цыкурин, то есть сын Цыкуна. Суффикс -ин характерен для фамилий, образованных от основ на -а/-я, поэтому форма «Цыкурин» закономерна. Если бы основа была на твёрдый согласный, мы бы получили фамилию Цыкуров, но её нет — это косвенно подтверждает, что исходное прозвище звучало именно как «Цыкун».

Географически фамилия тяготеет к югу России и к восточным регионам Украины (в частности, к Курской, Воронежской, Белгородской областям и к Слобожанщине). Там диалектная лексика с корнем «цык-» встречается чаще, чем в северных говорах. Встречается она и на Кубани, куда переселенцы принесли свой говор.

Интересно, что фамилия Цыкурин не фиксируется в классических дворянских родословных книгах и не имеет «громких» исторических носителей. Это фамилия крестьянского или мещанского сословия, возникшая в среде, где прозвища давали по метким бытовым приметам. Редкость фамилии может говорить о том, что родоначальник был заметной фигурой в своей местности, но род не разросся широко, либо фамилия была изменена при переписях.

В написании возможна путаница с фамилией Цикурин, где корень может восходить к «цикута» (ядовитое растение) или к редкому имени Цикурий. Но для формы «Цыкурин» с твёрдым «ы» более убедительна именно звукоподражательная версия.