Фамилия Цынкаленко — яркий пример украинской фамилии, образованной по продуктивной модели с суффиксом -енко. Этот суффикс, изначально уменьшительный, в украинской ономастике примерно с XVI века закрепился как патронимический: он означал «сын» или «потомок» (Цынкаленко — «сын Цынкала»). Такие фамилии особенно массово закреплялись в Левобережной и Слободской Украине, входившей в состав Гетманщины, и в южных регионах.

Основа фамилии — прозвище Цынкал. Самая прямая и правдоподобная версия связывает его с ремеслом: «цынка» (или «цинка») в южнорусских и украинских говорах — жесть, тонкое листовое железо. Соответственно, Цынкалом могли называть жестянщика, лудильщика или мастера по кровельному железу. В украинских диалектах есть слово «цинькувати» — паять, лудить, что полностью подтверждает эту связь. В пользу этой версии говорит и то, что фамилии от названий ремёсел (Коваленко, Бондаренко, Шевченко) — одни из самых распространённых на Украине.

Менее вероятна, но не исключена версия от имени Цынка как производной формы канонического имени Целестин (или, реже, Каллиник). В народе такие имена могли усекать и переделывать, прибавляя суффикс -к(о). Однако для украинской среды такая основа редка, а связь с жестью и паянием лексически куда прозрачнее.

Фонетический нюанс: начальное «Ц» вместо ожидаемого «Ци» (Цинкаленко) — либо результат закрепления акающего произношения в письменном виде, либо диалектная черта. Встречаются варианты написания Цинкаленко и Цинкаленко, но форма с «ы» устойчиво бытует, особенно у потомков выходцев с Полтавщины и Черниговщины. Социально фамилия указывает на казацкое или крестьянское происхождение: в реестрах XVII–XVIII веков «енко» — типичное окончание для рядовых казаков и посполитых.