Основой фамилии Цыплухин послужило мирское имя Цыпля. Очевидно, Цыплуха - это производная форма мирского имени Цыпля, которое образовано от аналогичного нарицательного. В старину цыплей называли цыплёнка, птенца курицы. Слово «цыплёнок» сегодня иногда употребляется в качестве ласкового обращения, так и нарицательное «цыпля» могло иметь то же значение. Таким образом, Цыплей могли назвать горячо любимого ребёнка. Менее вероятно, что в основе фамилии Цыплухин лежит прозвище Цыпля. В переносном значении цыплёнком (цыплей) могут называть молодого, незрелого, неопытного, возможно, робкого человека. Также не исключено, что прозвище Цыпля получил человек, занимавшийся разведением и продажей кур. Таким образом, потомок человека, обладающего именем Цыплуха, со временем получил фамилию Цыплухин.