Фамилия Тугушова образована от мужского имени или прозвища Тугуш. В её основе лежит тюркский корень «туг» — знамя, бунчук. В кочевых обществах «туг» был не просто флагом, а символом власти и воинского подразделения. Соответственно, Тугушем могли прозвать человека, имевшего отношение к знамени: знаменосца, военачальника, либо того, кто отличался статью и видом, как боевое знамя.

Суффикс -ов указывает на типичную русскую модель патронимической фамилии: Тугушов — сын Тугуша. Такие фамилии массово закреплялись у крещёных народов Поволжья и Приуралья в XVII–XIX веках, когда татары, башкиры, чуваши и мордва получали фамилии по имени отца. Тугушова — это женская форма, в мужском роде фамилия звучит как Тугушов.

Географически фамилия чаще всего встречается в Татарстане, Башкортостане, Оренбургской и Челябинской областях. В этих регионах тюркские имена с корнем «туг» были обычны. Встречается также вариант Тукашев — от другого производного имени Тукаш, но Тугушов стоит особняком: в нём сохранился древний воинский оттенок, который в других фамилиях стёрся.

В некоторых говорах «тугуш» могло означать не только знамя, но и «крепкий, тугой» — характеристика физической силы или упрямства. Однако первая версия, через знамя, более состоятельна: в ономастике тюркские имена от «туг» хорошо документированы (например, Туган, Туглук), а прямое прозвище по качеству характера встречается реже.