Фамилия Тунекова — женская форма; мужская — Тунеков. Она образована по стандартной русской модели с суффиксом -ов, который в древности указывал на принадлежность: «сын Тунека». В центре фамилии — прозвище или нецерковное имя Тунек.

Что могло означать это имя? Наиболее вероятная версия отсылает к диалектному слову «тун» — в ряде говоров так называли бездельника, лодыря, а также бродягу или нерадивого человека. Отсюда же известное прилагательное «тунеядный». В таком случае Тунек — это прозвище, данное либо человеку с соответствующим характером, либо, по народной иронии, наоборот, трудолюбивому. Вторая версия, менее распространённая, связывает основу с тюркским «тун» (ночь, тёмный) или «тунек» (переночевать). Эта гипотеза правдоподобна для регионов, где русские фамилии впитывали тюркские корни, но для фамилии Тунекова она слабее: суффикс -ек в русских прозвищах чаще уменьшительно-ласкательный, а не прямой заимствованный.

Географически фамилия Тунекова встречается довольно редко, преимущественно в центральных и южных областях России, что подтверждает её исконно русское происхождение от прозвища. Социальный контекст прост: носитель такой фамилии в XVI–XVII веках мог быть крестьянином или посадским человеком, получившим прозвище за манеру поведения или образ жизни. Никакого отношения к дворянству или известным историческим родам фамилия не имеет — это типичная «прозвищная» фамилия, каких тысячи на русском Севере и в Черноземье.

Если сравнивать с однокоренными, то фамилия Тунеков родственна более известной Тунеев (от Туней) или Тунин (от Туня). Различие в суффиксе -ек придаёт основе более конкретное, уменьшительное звучание: Тунек — это «маленький тун» или «тун, которого зовут ласково». Такая форма часто закреплялась в семьях, где прозвище передавалось по наследству и со временем утратило негативный оттенок, став просто фамильным именем.