Фамилия Тышкеев — яркий пример того, как одна буква в корне меняет всю этимологию. С первого взгляда её хочется связать с тюркским словом «тыш» (зуб), но на деле основа, скорее всего, славянская, искажённая диалектным произношением.

Вероятнее всего, Тышкеев — это вариант фамилии Тышкевич или Тышков, образованный через суффикс -ев от прозвища Тышко. А Тышко, в свою очередь, — уменьшительная форма от имени Тихон (через народную форму Тих, где «х» перешло в «ш» под влиянием акающих говоров: «Тихо» звучало как «Тышо»). Такое чередование согласных — «х/ш» — типично для северо-западных русских и белорусских говоров. Таким образом, предок носителя фамилии мог быть Тихоном, которого в быту звали Тышком, а его потомки стали Тышкеевыми.

Менее вероятна, но возможна версия от тюркского «тыш» (зуб) с добавлением русского суффикса -еев. В этом случае прозвище Тышкей могли дать человеку с приметными зубами или, в переносном смысле, острослову. Однако против этой гипотезы говорит то, что фамилии на -еев от тюркских корней обычно сохраняют «к» в основе (как Тюлькеев, Каракеев), а здесь мы видим смягчение «к» в «ке», что опять же отсылает к славянской модели с суффиксом -к-.

Суффикс -еев (а не -ов) указывает на то, что основа оканчивалась на мягкий согласный или «й»: Тышкей → Тышкеев. Такая модель распространена в южнорусских и украинских землях, где прозвища с уменьшительным суффиксом -ей были обычны.

Географически фамилия редкая, встречается точечно в центральных областях России и в Поволжье. В дореволюционных переписях её носители — чаще крестьяне или мещане, что подтверждает бытовое, а не боярское происхождение.

Если суммировать: скорее всего, Тышкеев — это «переоформленный» Тышкевич, где белорусский суффикс -евич заменился на русский -ев, или самостоятельная фамилия от прозвища Тышкей, восходящего к имени Тихон.