Фамилия Устиненков хранит память о крестильном имени дальнего предка и о тех землях, где это имя звучало особенно часто. В её основе лежит каноническое имя Юстин, которое пришло на Русь вместе с христианством из Византии. Само имя восходит к латинскому слову «юстус», что значит «справедливый», так что в глубине этой фамилии — пожелание или признание честности и праведности её первого носителя.

В народной среде полное церковное имя Юстин быстро прижилось в упрощённой, более удобной для повседневной речи форме — Устин. Именно от этого обиходного варианта и пошла фамилия. Вопрос о том, как именно её образовали, — самый интересный. Классическая русская модель — это суффикс -ов, дающий фамилию Устинов. Здесь же мы видим цепочку: Устин → Устиненко → Устиненков. Суффикс -енко — верный признак того, что фамилия складывалась под восточно-украинским влиянием, в тех регионах, где пересекались русская и украинская традиции имяобразования. Позже, при переезде носителей в великорусские губернии или при оформлении документов, к украинской основе добавили привычный русский суффикс -ов, чтобы «обрусеть» окончательно. Так и получилась двойная, но очень характерная для пограничья форма — Устиненков.

По сути, фамилия отвечает на вопрос «чей ты?» — ты из рода Устиненко, то есть потомок Устина. Такая модель с двойным суффиксом встречается реже, чем простая Устинов или Устинович, и это делает фамилию своеобразным маркером: она указывает не только на имя предка, но и на географию семьи, на её путь с украинских земель на север и восток.

Точное время и место возникновения фамилии назвать сложно: процесс формирования отчеств и фамилий в этих краях растянулся на несколько столетий и завершился лишь к концу XIX века. Однако сама конструкция — редкое сочетание уменьшительной формы имени, украинского патронимического суффикса и русского окончания — делает Устиненковых любопытным памятником славянской письменности, где в одной фамилии сплелись сразу две культурные традиции.