Фамилия Усынин образована от прозвища Ус (Усыня), которое мог получить человек с пышными усами. Так, из письменных источников известны боярин Иван Федорович Ус Товарков-Пушкин (1471—1484), Яков Усов, казнённый в 1570 году в новгородском погроме, новгородские помещики Усовы (конец XV века и позже). Таким образом, потомок человека, обладающего прозвищем Ус (Усыня), со временем получил фамилию Усынин.