Фамилия Вачинич — один из тех случаев, где суффикс сразу выдаёт географию. Окончание -ич характерно для южнославянских фамилий, особенно сербских, хорватских и черногорских. В русской среде такие фамилии встречаются редко и, как правило, указывают на балканские корни предка либо на его происхождение из регионов, где долгое время жили сербы или хорваты (например, в бывших военных границах Австрийской империи или в Новороссии, куда переселялись славяне с Балкан).

Основа фамилии — Вачин. Скорее всего, это производное от личного имени или прозвища. Самый прямой вариант: от имени Вача — краткой формы от Вячеслав или Вацлав (чешский аналог того же имени). В южнославянской среде имя Вача могло быть самостоятельным или уменьшительным. Суффикс -ич в таком случае означает «потомок Вачи» или «сын Вачи», что типично для сербской патронимической модели.

Менее распространённая гипотеза связывает основу со словом «вач» — в некоторых говорах так называли колдуна или знахаря, но это локальное и не слишком надёжное объяснение. Для южных славян более характерно образование фамилий от крестильных имён, а не от нарицательных прозвищ, поэтому версия с именем выглядит предпочтительнее.

Фамилия редкая. В России её носители — почти наверняка потомки переселенцев с Балкан или люди, чьи предки сменили фамилию при переезде. В самой Сербии или Хорватии Вачиничи встречаются чаще, но тоже не относятся к числу массовых. В архивных записях XIX века такую фамилию можно встретить среди жителей Воеводины или Далмации.