Фамилия Вачин — один из тех случаев, когда за основу взято не имя или прозвище человека, а название места, где он жил или откуда пришёл. Такая модель образования (географическое название + суффикс -ин) типична для русских фамилий, указывающих на принадлежность к определённой местности: «чей?» — «из Вачи». Так что предок носителя этой фамилии, скорее всего, был выходцем из населённого пункта с названием Вача.

На территории России известно несколько таких топонимов. Это река Вача в Иркутской области, посёлок городского типа в Нижегородской области, населённый пункт в Карелии и ныне не существующее село в Тамбовской области. Само название Вача имеет финно-угорские корни. Лингвисты связывают его с марийским словом «ваче» — «плечо». Смысл названия мог быть переносным: река Вача — это приток, ответвление, «плечо» более крупной реки. Позже это имя реки перешло на селения, возникшие на её берегах.

Менее вероятна, но возможна связь фамилии с прозвищем Вача. В некоторых говорах «вача» означало «вялый, медлительный человек» или имело иные диалектные значения. Однако географическая версия выглядит убедительнее: суффикс -ин в русских фамилиях чаще присоединялся к основам на -а, -я именно от названий мест (сравните: Москва — Москвин, Кострома — Костромин, Вача — Вачин).

Фамилия редкая и не имеет отношения к дворянским родам — она крестьянская или мещанская по происхождению. Среди известных носителей можно назвать разве что советского организатора производства Анатолия Вачина, но в целом фамилия не получила широкой известности за пределами регионов, где находятся одноимённые топонимы.