Фамилия Вагис образована от литовского нарицательного vaga, что в переводе на русский язык означает «борозда». Так, предок обладателя фамилии Вагис мог заниматься земледелием (например, был пахарем). Менее вероятно, что в основе фамилии лежит литовское vagis - «вор». В этом случае так могли прозвать нечестного на руку человека. Однако, не исключено, что прозвище имело так называемую «охранительную» функцию. Согласно суеверному обычаю, существовавшему у многих народов, подобные внутрисемейные прозвища присваивались детям с целью отвращения злых сил. В данном случае, надеясь иметь честного и порядочного мальчика, родители назвали его Вагисом.