Фамилия Вахитова образована от мужского имени Вахит, которое имеет арабские корни и означает «единственный». В традиционной мусульманской культуре так часто называли первенца-мальчика, подчеркивая его уникальное положение в семье. Имя Вахит восходит к тому же корню, что и одно из имён Аллаха — аль-Вахид («Единый»), что придаёт фамилии дополнительный религиозно-философский оттенок.

С точки зрения словообразовательной модели, фамилия Вахитова относится к типичному для татарской и башкирской ономастики патрониму: к основе имени Вахит добавляется суффикс -ов, а затем окончание -а, указывающее на принадлежность к женскому роду. В русской традиции такие фамилии передавались по мужской линии (Вахитов → Вахитова), поэтому носительница фамилии Вахитова — это, как правило, дочь или жена человека по имени Вахит.

Географически фамилия наиболее распространена в Татарстане, Башкортостане, а также среди татарских общин в других регионах России и странах СНГ. Встречаются и варианты написания — Вахитов (мужской род), а также близкие по корню фамилии Вахитовский, Вахитшин, образованные от тех же основ, но с разными суффиксами.

Процесс закрепления фамилий у татар и башкир шёл неравномерно: у сельского населения они массово фиксировались лишь в XIX — начале XX века, после введения всеобщей переписи. Поэтому точно определить, в каком именно селе или городе впервые появилась фамилия Вахитова, можно только через углублённые генеалогические изыскания. Однако сам факт, что она образована от личного имени, а не от прозвища или профессии, говорит о её древней, доклассовой основе: предки носителей фамилии скорее всего были свободными крестьянами или ремесленниками, а не выходцами из знатных родов.

Если сравнивать с однокоренными фамилиями, то Вахитова стоит в одном ряду с такими распространёнными татарскими патронимами, как Сафиуллина, Габдуллина, Хайруллина — все они образованы от арабских имён с религиозной семантикой. Но в отличие от них, имя Вахит не содержит суффикса «улла» (от араб. «Аллах»), что делает его более лаконичным и древним по форме.