Фамилия Вахотин образована от имени собственного и относится к распространенному типу русских фамилий. Основой фамилии Вахотин послужило церковное имя Вахтисий. Фамилия Вахотин ведет свое начало от имени Вахотя, разговорной формы крестильного мужского имени Вахтисий. Это имя имеет персидское происхождение и переводится на русский язык как «счастливый». Таким образом, потомок человека, обладающего именем Вахотя, со временем получил фамилию Вахотин. О точном месте и времени возникновения фамилии Вахотин в настоящее время говорить сложно, поскольку процесс формирования фамилий был достаточно длительным. Тем не менее, фамилия Вахотин представляет собой замечательный памятник славянской письменности и культуры.