Основой фамилии Вахотина послужило церковное имя Вахтисий. Фамилия Вахотина ведет свое начало от имени Вахотя, разговорной формы крестильного мужского имени Вахтисий. Это имя, предположительно, имеет персидское происхождение и переводится на русский язык как «счастливый». За отказ их жестоко истязали. Однако мучителям не удалось сломить веру святых в Христа. Скорее всего, основатель рода Вахотиных был человеком из простого сословия. Таким образом, потомок человека, обладающего именем Вахотя, со временем получил фамилию Вахотина.