Фамилия Вахтеркина — женская форма, а мужская, Вахтеркин, образована по стандартной русской модели с суффиксом -ин. Этот суффикс указывает на принадлежность: Вахтеркин буквально означает «сын Вахтерки» или «человек из семьи Вахтерка». Сама основа фамилии неочевидна на первый взгляд и вызывает вопросы.

Самая прямая и правдоподобная версия — происхождение от прозвища Вахтерка. В русских говорах «вахтер» — это сторож, надзиратель, человек, который «вахтит», то есть караулит или дежурит. Слово заимствовано из немецкого Wächter (сторож) через польское посредничество или напрямую из голландского, что особенно вероятно для петровской эпохи, когда в Россию пришло много морских и административных терминов. Уменьшительная форма Вахтерка могла относиться к младшему сторожу, помощнику вахтера или просто к человеку, который нёс караульную службу. Таким образом, предок носителя фамилии мог работать сторожем, привратником или, в более широком смысле, отвечать за порядок и наблюдение.

Менее вероятна, но возможна связь с личным именем или прозвищем Вахтер, которое иногда выводят из крестильного имени Варфоломей (арамейское «сын вспаханной земли»). В народной речи Варфоломей мог сокращаться до Вахра, Вахруш, а теоретически — и до Вахтер. Однако эта версия слабее: переход от «Варфоломей» к «Вахтер» требует лишних фонетических допущений, тогда как профессиональное прозвище лежит на поверхности.

Суффикс -к- в основе (Вахтер-к-а) характерен для прозвищ, образованных от названий профессий с оттенком уменьшительности или фамильярности. Сравните: дворник — Дворничка, кузнец — Кузнечка. Такие формы бытовали в крестьянской и мещанской среде, где прозвища часто закреплялись за конкретным человеком как его второе имя. Фамилия Вахтеркина — редкая, она не входит в списки самых распространённых русских фамилий, что говорит о её локальном происхождении: скорее всего, она возникла в одной местности, где жил и работал человек по прозвищу Вахтерка.

Географически фамилия может тяготеть к северо-западным и центральным регионам России, где исторически было сильно немецкое влияние (Петербургская, Новгородская, Псковская губернии) или где существовали заводские и горнозаводские производства, на которых вахтеры и сторожа были обычной должностью. В любом случае, основа фамилии — не имя, а занятие: предок Вахтеркиных был человеком, который «вахтил», то есть нёс службу, охранял или следил за порядком.