Фамилия Ваненков образована от имени собственного и относится к распространенному типу русских фамилий. Основой фамилии Ваненков послужило церковное имя Иоанн. Мужское крестильное имя Иоанн (русская форма - Иван) в переводе с древнееврейского означает «милость Божья». В основу же фамилии Ваненков легла одна из его уменьшительных форм - Ваня. Среди святых покровителей имени - Иоанн Креститель (Предтеча), один из самых почитаемых святых, предсказавший пришествие мессии, и апостол Иоанн Богослов, автор Евангелия и Книги Откровения. Скорее всего, фамилия Ваненков изначально возникла на территории Украины или Белоруссии, о чем свидетельствует характерный суффикс -енко. Со временем, вероятно, род Ваненко переехал в Россию, где и произошла русификация фамилии путем добавления суффикса -ов. О точном месте и времени возникновения фамилии Ваненков в настоящее время говорить сложно, поскольку процесс формирования фамилий был достаточно длительным. Тем не менее, фамилия Ваненков представляет собой замечательный памятник славянской письменности и культуры.