Фамилия Ванченков образована от прозвища или имени Ванча, а тот, в свою очередь, — уменьшительная форма от Иван. Суффикс -енк- в основе указывает на украинское или белорусское происхождение: Ванченко — «маленький Ваня» или «сын Вани». А уже на русской почве к этой форме добавили типичный великорусский суффикс -ов, что дало фамилию Ванченков. Такая двойная модель (сначала уменьшительный суффикс, потом патронимический) встречается нечасто и говорит о том, что предок носителя фамилии, скорее всего, переселился в великорусские земли с юго-запада — из современных Украины или Белоруссии, где фамилии на -енко распространены повсеместно.

Корень восходит к каноническому имени Иоанн (в русском быту — Иван), которое было самым частым мужским именем на Руси. Ванча — одна из многих народных форм наряду с Ваня, Ванька, Ванюта. В документах XVII–XVIII веков встречаются крестьяне и казаки с прозвищем Ванча, от которого позднее и закрепилась фамилия.

С точки зрения социального статуса, Ванченковы — почти наверняка потомки крестьян или однодворцев. Фамилии с суффиксом -ов на базе украинских форм обычно возникали не в дворянской среде, а в среде крестьян, переселявшихся на новые земли (например, в Слобожанщину или на Дон). Географически фамилия тяготеет к южным областям России — Курской, Воронежской, Ростовской, а также к востоку Украины.

В написании возможны варианты: Ванченков (с двумя «н») и реже Ванченков (с одним «н» — от Ванченко, что менее типично). Встречается также фамилия Ванченко без русского суффикса — она осталась в исходной украинской форме.