Фамилия Варапо — редкая и неочевидная. В ней нет ни типичного русского суффикса -ов/-ев, ни -ин, ни -ский, а значит, её происхождение лежит за пределами основной массы русских фамилий, образованных от полных или уменьшительных форм крестильных имён.

Скорее всего, перед нами фамилия, закреплённая в документах в том виде, в каком её услышали писцы. Основа «Варап» или «Варапо» может восходить к прозвищу или имени из неславянских языков. Одна из рабочих версий — связь с румынским или молдавским словом «vară» (лето) или «varap» (в некоторых говорах — глина, раствор для стройки). В таком случае прозвище Варапо могли дать человеку, работавшему с глиной (маляру, штукатуру) или родившемуся в жаркую пору. В Молдове и на юго-западе Украины фамилии с таким финалом встречаются чаще, чем в центральной России.

Другой вариант — искажённая запись греческой или тюркской основы. В тюркских языках есть корень «var» (есть, имеется) с разными аффиксами, но «Варапо» не складывается в типичную тюркскую модель. В греческом языке «varapi» (βαράπι) — устаревшее название тяжёлой ткани или войлока, и прозвище могло относиться к торговцу сукном. Однако это уже область догадок: прямых подтверждений в ономастических справочниках по этой фамилии нет.

С точки зрения словообразования, фамилия не получила русского патронимического суффикса — её записали как есть, в «голой» основе. Это характерно для фамилий, которые фиксировались в южных и западных губерниях Российской империи, где польское, украинское или молдавское влияние ослабляло стандартную русскую модель на -ов. Варапо — яркий пример того, как фамилия хранит не столько значение, сколько след миграции или этнического смешения.

Если вы носите эту фамилию, имеет смысл искать её корни не в общерусских списках, а в метрических книгах Бессарабской губернии, Херсонщины или Подолья — именно там вероятность найти первых известных Варапо наиболее высока.