Фамилия Вараев, скорее всего, образована от имени или прозвища, в основе которого лежит слово «вар» или «вара». В древнерусском языке «вар» означало «жар, зной», а также «кипяток» или «смола». Поэтому прозвище Вар могли дать человеку с горячим, вспыльчивым нравом или, наоборот, тому, кто занимался вываркой соли, смолы или варкой пива — варению и кипячению. В этом случае Вараев — потомок Вара, человека, чья профессия или характер были связаны с «варом».

Но есть и другая, не менее интересная версия. Она отсылает к так называемым «обрядовым именам». Во многих культурах, в том числе и у славян, существовала традиция давать детям имена-обереги, которые должны были принести счастье, здоровье или удачу. Слово «вара» в некоторых славянских говорах означало «защита», «оберег», «убежище». Имя Вар могло стать таким обережным именем: родители надеялись, что оно убережет ребенка от бед. Тогда Вараев — это «защитник», потомок того, кому дали имя-оберег.

Фамилия образована по стандартной русской модели с помощью патронимического суффикса -ев, который присоединялся к основам на мягкий согласный (Варь → Варьев) или к именам, оканчивающимся на -а/-я (Варя → Варьев). Однако форма Вараев с ударением на второй слог (Варáев) указывает на то, что исходная основа — Варáй. В украинском и южнорусском именослове суффикс -ай часто служил для образования ласкательных или обиходных форм имен (как Минай от Мина, Макай от Макар). Варай — это производное от того же корня «вар», то есть либо «горячий, вспыльчивый человек», либо «оберегаемый». Таким образом, Вараев — «сын Варая».

Встречается фамилия в разных регионах, но особенно характерна для Северного Кавказа, где могла возникнуть и среди горских народов, адаптировавшись к русской модели. В осетинском языке, например, «уа́р» означает «любовь», а «уа́ра» — «любимый», что делает возможным и тюрко-кавказский след. В таком случае Вараев — это русифицированная форма фамилии от имени или прозвища со значением «любимый». Эта версия не менее правдоподобна, чем славянская, и объясняет распространенность фамилии на юге России.