Фамилия Вардавьянц сразу обращает на себя внимание редким окончанием -янц. Это верный признак армянского происхождения, причём довольно старого. В современном армянском языке самый распространённый патронимический суффикс — -ян (или -янц в диалектах). Форма -янц, как в данном случае, типична для западных диалектов армянского языка и для фамилий, которые закрепились в написании ещё в XIX — начале XX века. Она означает «из рода» или «принадлежащий к» тому, кто назван в корне.

Основа фамилии — Вардавьян (Vardavyan). Она, в свою очередь, восходит к личному имени или прозвищу Вардав. Наиболее вероятная версия: в основе лежит армянское имя Вардан (Vardan), которое происходит от слова «вард» — «роза». В таком случае Вардав — это диалектный или сокращённый вариант имени Вардан, а Вардавьянц — «из рода Вардана», «потомок Вардана». Имя Вардан было широко распространено в армянской среде, в том числе благодаря известному полководцу V века Вардану Мамиконяну.

Менее распространённая, но возможная версия связывает фамилию с топонимом. В исторической Армении существовали селения с похожими названиями, например, Вардаван. Тогда Вардавьянц мог означать выходца из такого места. Однако для фамилии, заканчивающейся на -янц, патронимическая модель (по отцу или предку) всё же первична.

Географически носители фамилии Вардавьянц встречаются в основном на юге России, в Краснодарском крае, Ростовской области и в Ставрополье. Это связано с переселением армян из Западной Армении (территории Османской империи) в XIX веке. Именно в этих потоках беженцев и переселенцев форма -янц сохранялась дольше, чем в Восточной Армении, где к советскому времени её почти вытеснил суффикс -ян. Среди однокоренных фамилий — Варданян, Варданов, Варданянц, Вардавский, но Вардавьянц выделяется своим архаичным диалектным окончанием, которое прямо указывает на регион происхождения предков — историческую Западную Армению.