Фамилия Васючкина образована от имени Васючка — одной из множества уменьшительных форм крестильного имени Василий. Имя Василий (в переводе с греческого — «царский, царственный») в прошлом занимало по частоте употребления второе место после имени Иван, поэтому от него произошло огромное количество производных форм, и все они ложились в основу фамилий. Васючка — это именно та форма, которую использовали в быту, в кругу близких, и она закрепилась за родом.

Василий — имя многих почитаемых святых: святого мученика Василия Афинянина, священномученика IV века Василия Анкирийского, новгородского святителя Василия Блаженного, совершившего подвиг юродства и обличавшего ложь и лицемерие. Однако популярность имени в народе объясняется не только церковным почитанием, но и тем, что оно было привычным, «своим» для всех сословий.

Модель образования фамилии типична для русского Северо-Запада и центральных областей: суффикс -ин указывает на принадлежность («чей?» — Васючкин). Васючкина — это форма женского рода, но исторически фамилия закрепилась в мужском варианте Васючкин, а затем, по правилам русской грамматики, для женщин используется окончание -а. Скорее всего, основатель рода Васючкиных был человеком из простого сословия — крестьянином или ремесленником, которого в документах записали по имени-прозвищу Васючка, без отчества и сословного титула.

Примечательно, что фамилия Васючкина встречается реже, чем однокоренные Васин, Васькин или Васильев. Это говорит о том, что форма Васючка была менее распространена в официальных переписях, но бытовала в устной речи. Таким образом, потомок человека по имени Васючка со временем получил фамилию Васючкина, и в ней сохранился отзвук той живой, разговорной традиции, которая существовала в русских деревнях и слободах.