Фамилия Ватис предположительно образовано от аналогичного древнего литовского имени которое, возможно, происходит от литовского слова vadas - «вождь, ведущий, передовой». Согласно другой версии, имя Ватис представляет собой литовскую форму крестильного имени Вата. Имя Вата восходит к греческому слову «батос» и означает «терновник, купина».