Фамилия Ваученкова — женская форма фамилии Ваученков, а та, в свою очередь, образована от мужского прозвища или имени Ваученко. Словообразовательная цепочка здесь нестандартная: суффикс -енк(о) типичен для украинских и южнорусских фамилий (указывает на «малого», «сына» или «подмастерья»), а основа Вауч- — самая спорная часть.

Скорее всего, корень восходит к глаголу «ва́укать» — в некоторых говорах так называли невнятное бормотание, крик или звуки, похожие на вой. Человек, который «ваукал», мог получить прозвище Вау́ка, а его сын становился Ваученком. В этом случае фамилия — звукоподражательная, отсылающая к манере речи или голоса предка. Менее вероятна, но возможна связь с диалектным «ва́улить» (медлить, тянуть) или с искажённым именем Вавила (в просторечии — Ваула).

Суффикс -ов(а) в окончании указывает на принадлежность: Ваученкова — буквально «жена или дочь Ваученка». Такая модель — типичное явление для русских фамилий XIX века, когда женские формы образовывались от мужских через притяжательный суффикс.

Географически фамилия редкая и локализована. По данным современных телефонных справочников, Ваученковы встречаются в основном в Воронежской и Ростовской областях, а также на юге Украины — то есть в зоне смешения русских и украинских говоров. Это подтверждает версию о южнорусском или малороссийском происхождении.

Сравните с однокоренными: Ваулин, Ваулов, Вауков — все они строятся на той же звукоподражательной основе Вау-. Фамилия Ваученкова, в отличие от них, сохранила уменьшительный суффикс -енк-, что говорит о более позднем и, возможно, крестьянском происхождении: в среде, где прозвище давали не по отцу, а по самому человеку, но с оттенком «сын такого-то».

В итоге: предок носительницы фамилии, скорее всего, был крестьянином или казаком из южнорусских губерний, получившим прозвище Ваученко за манеру говорить или кричать. Фамилия недворянская, не распространённая в высших сословиях, и её редкость — дополнительный ключ к узкой региональной истории.