Фамилия Вайнилова — редкий случай, когда основа не бросается в глаза, а суффикс подсказывает пол носителя. Вайнилова — это женская форма, а мужская, соответственно, Вайнилов. Чтобы понять корни, нужно разобраться с мужским вариантом.

Суффикс -ов указывает на типичную русскую модель образования от прозвища или имени, оканчивающегося на согласный или -о. Основа здесь — «Вайнил». Самое правдоподобное объяснение: фамилия происходит от прозвища Вайнило. В русских говорах, особенно северных и сибирских, «вайнить» означало «ныть, плакать, жаловаться». Слово «вайнило» — тот, кто постоянно ноет, капризничает. Такое прозвище могли дать ребенку или взрослому с плаксивым характером. В словаре В. И. Даля глагол «вайкать» (плакать, хныкать) зафиксирован, и «вайнило» — его естественное производное.

Менее вероятная, но возможная версия — связь с еврейскими фамилиями на -ил, например, от имени Вайн (Wein, «вино» на идише). Однако суффикс -ов для таких фамилий в России нетипичен: еврейские фамилии чаще оканчиваются на -ер, -ман или -зон, а -ов в них встречается редко и обычно при русификации. Учитывая, что «вайнить» — живое диалектное слово, версия с прозвищем убедительнее.

Географически фамилия Вайнилов/Вайнилова встречается редко, в основном в центральной России и на Урале. Поскольку прозвище Вайнило — нецерковное, предок мог быть крестьянином или посадским человеком, которому дали такую кличку в быту. Фамилия закрепилась, когда прозвище перестало быть обидным и стало родовым именем. В документах XVII–XVIII веков подобные прозвища на -ило (Курило, Вопило, Вайнило) встречаются в писцовых книгах, что подтверждает их бытование.

Таким образом, Вайнилова — фамилия, образованная от прозвища, описывающего черту характера. Она стоит в одном ряду с Плаксиным, Нытиковым, Вопиловым — всеми, кто указывает на неспокойный нрав предка.