Фамилия Ванилова — женская форма фамилии Ванилов, а та образована от прозвища или нецерковного имени Ванило. Если сразу отбросить очевидную, но ложную ассоциацию с ванилью (пряность появилась в России поздно и вряд ли могла лечь в основу крестьянского прозвища), остаётся два варианта корня.

Первый и самый вероятный — диалектный глагол «ванить», который в северных и сибирских говорах означал «манить, привлекать, зазывать». Ванилой могли прозвать зазывалу на торгу, бойкого торговца или просто человека с даром уговаривать. В некоторых говорах «ванить» имело оттенок «обманывать, вводить в заблуждение» — тогда прозвище получал хитрец или льстец. Суффикс -ил- в таких прозвищах типичен для русского языка: он указывает на деятеля (ср. нытик, вопила, воротила). То есть Ванило — «тот, кто ванит».

Вторая версия — уменьшительная форма от крестильного имени Венедикт (через народное Ванюта, Ваня). Но здесь мешает суффикс -ил-, а не -я. Прозвища на -ило чаще образовывали от глаголов, а не от имён. Поэтому версия с «ванить» убедительнее.

Фамилия редкая, географически привязана к Русскому Северу и Сибири — в переписях XVII–XVIII веков Ваниловы встречаются в Вологодской губернии и на Урале. Суффикс -ов указывает на типичную русскую модель: «чей?» — сын Ванила. В современных справочниках фамилия почти не упоминается, что говорит о её малочисленности: скорее всего, она не вышла за пределы одной-двух локальных ветвей.