Фамилия Вечернин — редкий случай, когда основа и суффикс не совпадают по происхождению. С первого взгляда кажется, что корень «вечер» указывает на время суток, но суффикс «-ин» обычно присоединяется к основам на -а, -я (Вечеря → Вечерин). Здесь же мы видим «Вечерн-ин», что говорит об основе «Вечерня» или «Вечерний».

Самая вероятная версия: фамилия образована от прозвища Вечерня — человека, который посещал вечернюю церковную службу (вечерню) или был при ней пономарём, чтецом. В русских говорах «вечерней» называли и вечернюю трапезу, и время после заката, но прозвище скорее связано с храмом, чем с ужином. Модель типична для духовного сословия: фамилии на «-ин» от названий служб (Обеднин, Заутренев) встречаются в среде сельских причтов.

Менее вероятно, что фамилия — отчество от неканонического имени Вечерня (как Полдень, Зима). Такие имена давали по времени рождения, но архаичное «Вечерня» в документах почти не фиксируется. Ещё одна гипотеза — переосмысление топонима: если предок жил в селе Вечернее или на Вечернем хуторе, его могли записать как Вечернин, но подтверждений этому мало.

Фамилия почти не встречается за пределами России. По данным современных справочников, наибольшая концентрация носителей — в Тверской и Ярославской областях, что косвенно подтверждает связь с северным духовенством. В XIX веке фамилия могла писаться с двумя «н» — Вечернинъ, но корень от этого не меняется.

Однокоренные фамилии — Вечерин, Вечеров, Вечерский — различаются суффиксами. Вечерин, скорее всего, от имени Вечеря (вечернее застолье), а Вечернин сохраняет оттенок церковного обихода.