Фамилия Веденьева — женская форма, а мужская — Веденьев. В центре внимания здесь оказывается не корень, а суффикс: -ев, а не более привычный -ов. Такое написание встречается реже и часто указывает на мягкое произношение основы или на диалектную особенность. В русской ономастике фамилии на -ев обычно образуются от основ, оканчивающихся на мягкий согласный или на ц, ч, ш, щ. Значит, исходное прозвище или имя звучало как Ведень, а не Веден.

Самая вероятная версия происхождения — от глагола «ведать», то есть знать. В древнерусском языке «ведень» могло означать знающего человека, ведуна, колдуна или просто мудреца, которому ведомо то, что скрыто от других. В говорах слово «ведень» фиксировалось и как прозвище знахаря или опытного, бывалого человека. Менее вероятна, но возможна связь с именем Венедикт (от латинского benedictus — благословенный): в просторечии его могли сокращать до Веденя, Ведень.

По модели образования фамилия Веденьев — типичная патронимическая, то есть указывающая на отца по прозвищу. Предок носителя фамилии, скорее всего, был человеком, к которому обращались за советом или помощью, либо же — носителем редкого канонического имени в просторечной форме. Социальный слой — крестьяне или посадские люди центральной России, где такие прозвища были распространены.

Встречается фамилия преимущественно в центральных и северных регионах России, реже — на Урале. В документах XVII–XVIII веков можно найти отдельные упоминания крестьян Веденьевых в вотчинах под Ярославлем и Костромой, что косвенно подтверждает северное происхождение. Сравните с однокоренными фамилиями Веденин, Веденяпин — все они от той же основы «ведать», но с разными суффиксами, что даёт разные оттенки значения.