Фамилия Веденина в своей основе восходит к имени Венедикт, которое пришло на Русь из латыни. Латинское benedictus переводится как «благословенный», а по другой версии — «тот, о ком хорошо говорят». В народной речи имя быстро адаптировали: от «Венедикт» образовалась более короткая форма «Веденя» (по аналогии с Родион — Родя, Федот — Федя). Именно от неё с помощью суффикса принадлежности -ин и появилась фамилия. Суффикс -ин в русских фамилиях традиционно указывает на родство: «чей?» — «Веденин», то есть сын или потомок Ведени.

Словообразовательная модель здесь проста и прозрачна: усечённая форма имени + типичный притяжательный суффикс. Такие фамилии (Веденин, Веденина, Веденяпин) были широко распространены в крестьянской и мещанской среде, где полное церковное имя использовали редко, предпочитая домашние варианты. Интересно, что в некоторых говорах имя Венедикт произносили как «Веденихт», откуда пошли фамилии Веденихин и Ведениктов, но форма «Веденя» оказалась самой ходовой и дала жизнь фамилии Веденина.

Социальный контекст тоже говорит о многом: имя Венедикт в святцах встречается, но никогда не было частотным в аристократической среде. Поэтому фамилия Веденина — это скорее указание на происхождение из простонародья или духовного сословия (священники иногда давали детям «говорящие» имена). Географически фамилия чаще всего встречается в центральных и северных областях России — там, где имя Венедикт в бытовой форме «Веденя» сохранялось дольше всего.

Если сравнивать с однокоренными фамилиями, то Веденина стоит в одном ряду с Бенедиктовым (прямая книжная форма) и Веденеевым (от диалектного «Веденей»). Но именно через суффикс -ин фамилия указывает на прямую линию наследования от конкретного человека по имени Веденя — без посредников и переосмыслений.