Фамилия Веденникова — женская форма фамилии Веденников. В её основе лежит диалектное слово «веденник», которое в северных и сибирских говорах означало знахаря, колдуна или человека, ведущего особый, отшельнический образ жизни. Корень здесь тот же, что у глагола «ведать» — знать. То есть Веденников — потомок человека, который либо занимался народным целительством, либо считался сведущим в тайных делах, либо просто получил такое прозвище за свою замкнутость и нелюдимость.

Модель образования типична для русских фамилий: суффикс -ов/-ев присоединялся к основе, указывая на принадлежность («чей сын?» — Веденников). Однако интересна конкуренция с похожей фамилией Веденеев. Веденеев происходит от канонического имени Венедикт (латинское «благословенный»), которое в народе часто искажали до Веденей. У Веденникова же связь с церковным именем неочевидна: суффикс -ник указывает на деятеля, а не на производное от имени. Поэтому версия с прозвищем или профессиональным названием выглядит правдоподобнее, чем гипотеза о происхождении от крестильного имени.

Географически фамилия тяготеет к Русскому Северу и Уралу. В переписных книгах XVII века встречаются крестьяне и посадские люди с этой фамилией в Вятской и Пермской губерниях. Встречается вариант с одним «н» — Ведеников, но он редок и обычно является результатом упрощения на письме. В современной России фамилия нечастотная, сохранилась в основном в Кировской области, Пермском крае и Удмуртии.

Двойственность значения — от «знающего» до «чуждающегося людей» — отражает народное отношение к таким персонам: уважение к знаниям смешивалось с опаской. Носительница фамилии Веденникова может считать, что её предки были людьми нестандартными, стоявшими особняком в деревенской общине.