Фамилия Вердоян — характерный пример армянской модели фамилии на -ян, которая восходит к древнейшему суффиксу принадлежности -янц (позже сократившемуся до -ян). Этот суффикс означает «из рода такого-то» или «принадлежащий к семье». В основе фамилии лежит личное имя или прозвище Вердо. В армянском языке имя Вердо (или Вардо) — это краткая форма от имени Вардан, одного из самых распространённых древнеармянских имён. Вардан означает «дар» или «награда» (от среднеперсидского *varta-), и в армянской истории это имя носили военачальники, святые и князья, в том числе знаменитый Вардан Мамиконян, возглавивший Аварайрскую битву. Таким образом, фамилия Вердоян изначально значила «из рода Вердо» — то есть потомка человека по имени Вердо (Вардан).

Географически фамилия Вердоян встречается в основном среди армян Западной Армении (исторические области Васпуракан, Сасун) и среди потомков армян, переселившихся на юг России, в Краснодарский край и Ростовскую область. В Армении фамилия распространена, но не массово — чаще в Ереване и в областях Арагацотн и Лори. Ударение падает на последний слог: Вердоя́н.

Отдельного внимания заслуживает написание: в русской передаче фамилия пишется через «е», хотя в армянском оригинале (Վերդոյան) начальная гласная ближе к «э». Это особенность русской транскрипции армянских фамилий, где «е» часто заменяет армянскую букву «է» (э) или «ե» (йэ). Поэтому не стоит путать её с фамилией Вердоян, образованной от русского слова «верда» (диалектное название верёвки или веретена) — такой вариант существует, но он крайне редок и не имеет отношения к армянской фамилии.

Социальный состав носителей фамилии типичен для армянских фамилий на -ян: среди Вердоянов есть и крестьяне, и ремесленники, и люди интеллигентных профессий. В советское время фамилия не подвергалась русификации (не меняла окончание на -ов или -ев), что говорит о сохранении национальной идентичности в среде носителей.