Фамилия Вергия — редкая, и её происхождение неочевидно. В отличие от массовых фамилий на -ов или -ин, она не вписывается в типичную русскую словообразовательную модель, что сразу указывает на иноязычные корни или на искусственное, книжное происхождение.

Скорее всего, перед нами фамилия, образованная от личного имени или прозвища. Основа «Верг-» вызывает несколько версий. Самая прямая отсылка — к латинскому virga («ветвь», «прут», «жезл»). В средневековой Европе это слово могло стать прозвищем для судейского чиновника (как символ власти) или для человека высокого и худого, похожего на прут. Фамилии с таким корнем встречаются в романских языках (итальянская Верга, французская Верж). В русском контексте фамилия могла появиться через греческое посредничество: греческое βέργα (вéрга) означает то же самое — «палка», «прут». Для греческих фамилий характерны окончания на -ия, -ас, -у, поэтому Вергия могла быть русифицированной формой греческой фамилии Вéргас или Вéрги.

Другая, менее вероятная версия, связывает фамилию с грузинским корнем «верг» — «волк». Однако для грузинских фамилий типичны окончания -швили, -дзе, -ия (например, Вергулия), а форма Вергия без суффикса встречается реже.

В русском языке фамилия могла возникнуть искусственно — в семинарской среде. Семинаристам часто давали фамилии от латинских слов: Вергин (от virgo — «дева»), Вергилий (в честь поэта). Вергия могла быть латинизированной формой от «Вергилий» или сокращением от «Вергин».

Географически фамилия встречается в основном на юге России, в Краснодарском крае и в Абхазии, что подтверждает её греческое или понтийское происхождение. Носители — потомки греческих переселенцев, которые в XIX–XX веках оседали на черноморском побережье.

Коротко: Вергия — почти наверняка фамилия греческого происхождения, означающая «прут» или «жезл». Первый носитель мог получить прозвище за высокий рост, за профессию (связанную с мерой длины или судом) или просто по имени предка. Русская народная этимология здесь не работает — фамилия пришлая.