Основой фамилии Вержаев послужило мирское имя Вержай. Марийское имя Вержай, вероятно, восходит к слову «вургече» - «среда» или «три». Соответственно, такое имя мог получить третий ребёнок в семье или тот, кто родился в среду. На марийское происхождение фамилии Вержаев дополнительно указывает финно-угорский формант –жай. Таким образом, потомок человека, обладающего именем Вержай, со временем получил фамилию Вержаев.