Фамилия Вильшанкова — женская форма, а мужская — Вильшанков. Ударение, скорее всего, падает на второй слог: Вильша́нков. В основе фамилии лежит географическое название, а точнее — название населённого пункта. Корень «Вильшан-» восходит к слову «ольха»: в некоторых славянских говорах, особенно в польском и белорусском, «ольха» звучит как «ольша» или «вильша» (польск. olsza, wolsza). Отсюда пошли названия многих сёл и деревень — Вильшаны, Вильшанка, Ольшанка. Таких топонимов особенно много на западе современной России, в Беларуси и на Украине.

Фамилию образовали по стандартной русской модели: к основе топонима добавили суффикс -ов/-ев. Это указывает на то, что первый носитель фамилии (Вильшанков) был либо выходцем из села Вильшанка, либо помещиком, которому принадлежала земля в таком месте. Суффикс -к- в основе (Вильшанк-ов) — уменьшительный, типичный для названий небольших деревень: Ольшанка, Вильшанка. Сама фамилия — относительно редкая, её нет в списках массовых русских фамилий, что говорит о локальном происхождении.

Версия о происхождении от прозвища «Вильшан» (человек, живущий у ольховой рощи) менее вероятна, хотя и не исключена. Прозвища по месту жительства в русской традиции чаще давались в форме прилагательного (Ольшаный, Вильшаный), а не существительного. Поэтому топонимическая версия надёжнее. Географически фамилия Вильшанков/Вильшанкова встречается в центральных областях России, а также в Поволжье — это следствие миграций крестьян после отмены крепостного права, когда люди из западных губерний (Смоленской, Могилёвской) переселялись на восток.

Сословно фамилия недворянская: суффикс -ов в сочетании с «деревенским» корнем указывает на крестьянское или мещанское происхождение. Дворянские фамилии от топонимов чаще оформлялись суффиксом -ский (Вильшанский). Так что предки носительницы фамилии, скорее всего, были крестьянами из деревни с ольховым названием.