Фамилия Витаниус — редкий случай, когда написание подсказывает происхождение почти без вариантов. В русской среде фамилии на -ус, -иус чаще всего пришли из польской или западнорусской традиции. Это не исконно русская модель, а искусственная, книжная: суффикс -ус (или -иус) в XVI–XVIII веках активно использовали семинаристы и выпускники духовных академий. Они переделывали простонародные фамилии на латинский манер, чтобы звучало учёно и благородно. Сравните: Смирнов мог стать Смирницким или Смирнагиусом, а простой Витанов — Витаниусом.

Основа фамилии — корень витан-. В нём легко угадывается либо личное имя Вит, Вита (от латинского vitalis — «жизненный»), либо славянское прозвище, связанное с глаголом «вить» (витать, обитать). Латинская версия правдоподобнее: в семинарской среде любили возводить фамилии к «благородным» латинским корням. Виталис — распространённое христианское имя, в русских святцах — Виталий. От него могли образовать фамилию Витанов (с русским суффиксом -ов), а потом «олатинить» до Витаниус.

Географически фамилия тяготеет к западным губерниям Российской империи — современным Беларуси, Литве, Польше. Встречается и у потомков польской шляхты, и у выходцев из духовного сословия. Сословная принадлежность, скорее всего, — духовенство или мелкая шляхта, реже — мещане. Крестьянам такие «учёные» фамилии давали редко.

Интересная деталь: фамилия Витаниус не входит в массовые сводки русских фамилий (например, у Унбегауна или Никонова), что подтверждает её редкость. Если носители сохранились в России, то, вероятно, в северо-западных областях или в среде потомков ссыльных поляков. В современном мире фамилия почти исчезла, уступив место более простым формам вроде Витанов или Витальев.