Фамилия Влагалищев — редкий случай, когда современное звучание настолько не совпадает с исходным значением, что вызывает скорее недоумение, чем догадки. На самом деле корень здесь не имеет никакого отношения к анатомии. Фамилия образована от прозвища или мирского имени Влагалище, а то, в свою очередь, — от слова «влагалище» в его прямом, древнем значении: «вместилище, футляр, чехол, ножны». В говорах так могли называть кошель, мешок или любой предмет, в который что-то кладут. Человек по прозвищу Влагалище — скорее всего, мастер, делавший такие вещи (кожевник, шорник, ножовщик), либо просто обладатель какой-то характерной сумки или мешка, который не снимал.

Суффикс -ев указывает на стандартную модель русской фамилии, означающую «сын Влагалища» или «из семьи Влагалищевых». Модель с суффиксом -ев, а не -ов, говорит о том, что основа прозвища заканчивалась на мягкий согласный или шипящий (в данном случае на «щ»). Фамилия не дворянская и не княжеская — это типичная фамилия крестьянского или посадского сословия, закрепившаяся при переходе от прозвищ к наследственным именованиям в XVII–XIX веках.

Географически фамилия встречается крайне редко, в основном в центральных и северных регионах России, где сохранилась старая лексика. В современных условиях носители фамилии, вероятно, сталкиваются с неловкими шутками, но этимологически их фамилия — ровесница фамилий Ножев, Мешков или Футляров. Спорных версий тут немного: некоторые любители народной этимологии пытаются связать её с глаголом «влагать» в переносном смысле, но это не подтверждается диалектными данными. Правдоподобнее всего версия с ремеслом или предметом быта.

Ономастические справочники (например, словарь русских фамилий Ю. Федосюка) фиксируют похожие прозвища: Влагаль, Влагальщик. Фамилия Влагалищев — их прямое продолжение, только с уменьшительно-увеличительным суффиксом -ищ-, который в прозвищах часто имел не буквальный размер, а ироничный или уважительный оттенок. Так что предок носителя этой фамилии был, скорее всего, мастеровым человеком, чьё прозвище означало «большой кошель» или «знатный футлярщик».