Фамилия Водолажченко образована по той же модели, что и Иваненко, где суффикс -енко указывал на «сына» или «потомка» (в украинской традиции). Только в основе здесь не имя, а прозвище — Водолага. Само прозвище происходит от слова «водолаз»: на юге России и в Украине водолазов называли водолагами. Так что Водолажченко — это буквально «сын водолаза» или «потомок водолага».

Прозвище Водолага давали не только профессиональным ныряльщикам, которые доставали со дна утопленников, якоря и грузы. В быту так могли назвать человека, который постоянно возился с водой: рыбака, лодочника, мельника или просто того, кто жил у реки и часто мочил одежду. В некоторых говорах слово «водолага» имело ироничный оттенок — так говорили о нерасторопном или мокром, как мышь, человеке.

Модель с суффиксом -енко типична для Поднепровья и Левобережной Украины. Фамилия Водолажченко встречается в основном в Черкасской, Полтавской и Кировоградской областях. В России она редка и чаще всего связана с переселенцами с Украины в XIX–XX веках.

Появление фамилии можно отнести к XVII–XVIII векам, когда у казаков и крестьян закрепились родовые прозвища. Первым носителем, скорее всего, был человек по прозвищу Водолага, а его дети уже стали Водолажченками. Со временем прозвище забылось, а фамилия осталась.

Среди однокоренных фамилий — Водолазов, Водолажский, Водолазченко. Но Водолажченко выделяется именно украинским суффиксом, который сразу указывает на происхождение предка из среды простых людей, а не дворянства. Это фамилия ремесленника или крестьянина, чей труд был связан с водой.