Фамилия Ворожкина — женская форма, а мужская, Ворожкин, образована суффиксом -ин, который в русских фамилиях указывает на принадлежность: «чей?» — Ворожкин, то есть сын или потомок человека по прозвищу Ворожка. Основа здесь — не имя, а прозвище, и это сразу задаёт направление поиска.

Ворожка — одно из народных названий колдуна, знахаря, ворожея. В русских говорах слово «ворожка» бытовало наряду с «ворожей» и «ворожбит», но имело чуть более бытовой, даже уменьшительно-пренебрежительный оттенок. Так могли называть человека, который занимался ворожбой — гаданием, лечением заговорами, приворотами. В крестьянской среде ворожей нередко уважали и побаивались одновременно, поэтому прозвище могло закрепиться и за самим знахарем, и за его домочадцами.

Есть и вторая, менее очевидная версия. В некоторых диалектах «ворожка» означала не человека, а предмет — узелок с травами или ладанку, которую носили на теле как оберег. Прозвище Ворожка в этом случае мог получить человек, который такие обереги делал или постоянно носил. Но лингвисты склоняются к первой трактовке: прозвище по роду занятий — самый частый сценарий для фамилий на -ин.

Словообразовательная модель типична для северных и центральных областей России. Фамилии на -ин от основ на -а (Ворожка → Ворожкин) особенно распространены в Новгородской, Вологодской, Костромской губерниях. В документах XVII века встречаются крестьяне и посадские с прозвищем Ворожка, но в фамилию оно оформилось позже, уже после отмены крепостного права, когда прозвища стали передаваться по наследству как официальные фамилии.

Сравнение с однокоренными фамилиями — Ворожейкин, Ворожбитов — показывает, что Ворожкина стоит в том же смысловом ряду, но с более простой, разговорной основой. Если Ворожейкин явно отсылает к книжному или церковному слову «ворожея», то Ворожкина звучит как деревенское, бытовое прозвище — менее пафосное, зато более живое.

Таким образом, предки носительницы фамилии Ворожкина с большой вероятностью были людьми, связанными с народной магией или знахарством, либо получили прозвище по характерной черте — например, за привычку носить с собой оберег. Точную географию можно уточнить по региональным архивным данным, но в целом фамилия нередкая и встречается по всей средней полосе России.