Фамилия Ворожцов образована от прозвища Ворожейка, которое давали знахарям, колдунам или ворожеям — людям, практикующим народную магию, заговоры и гадания. В основе лежит древнерусский глагол «ворожити» (ворожить, колдовать). Прозвище было широко распространено в крестьянской среде, где к таким людям относились с опаской, но и с уважением.

Словообразовательная модель фамилии — суффикс -ов, который указывает на принадлежность: Ворожцов буквально означает «сын Ворожца» или «потомок Ворожца». В данном случае «Ворожец» — это усечённая, обиходная форма от «Ворожейка» (как «кузнец» от «кузнец»). Суффикс -ов типичен для русских фамилий, образованных от прозвищ с конечным -ец или -ок.

Встречаются и однокоренные фамилии: Ворожейкин, Ворожеев, Ворожбит (украинский вариант). Все они восходят к тому же корню, но Ворожцов — одна из самых распространённых форм, характерная для центральных и северных губерний России.

Известный носитель фамилии — советский химик-органик Николай Николаевич Ворожцов (1881–1941). Он внёс значительный вклад в развитие анилинокрасочной промышленности СССР, и его работы до сих пор цитируются в специальной литературе. Однако в бытовом сознании фамилия прочно ассоциируется с народной магией, а не с наукой.

Главная особенность фамилии — её редкий, почти сказочный оттенок. В отличие от распространённых «ремесленных» фамилий (Кузнецов, Плотников), Ворожцов прямо указывает на занятие, граничащее с тайным знанием. Это делает её запоминающейся и непохожей на другие.