Фамилия Вощеникин — довольно редкая и прозрачная по происхождению. Она отчётливо указывает на занятие предка: вощение тканей или ниток. В основе лежит слово «вощеник» — так в старину называли мастера, который пропитывал материю воском, чтобы сделать её водонепропроницаемой, или натирал воском нитки для шитья кожи и обуви. Такая работа была востребована у сапожников, шорников и в крестьянском хозяйстве.

Суффикс -ин — типичная модель русских фамилий: Вощеникин значит «сын Вощеника» или «из семьи Вощеника». Если бы фамилия образовалась от географического названия, стоял бы суффикс -ский, но здесь всё указывает на прозвище по ремеслу. Интересно, что основа «вощеник» не так часто встречается в фамилиях: гораздо распространённее Вощинин, Вощагин или Вощажников, где корень тот же, но суффиксы другие. Вощеникин выделяется именно редким суффиксом -ик, который в русских прозвищах обозначал деятеля (ср. «кожевник», «пряничник»).

В документах фамилия могла писаться и через «а» — Ващеникин, поскольку в северных и центральных говорах аканье часто смещало «о» в безударной позиции. Однако в закреплённом виде сохранился этимологически верный корень «вощ-», связанный с воском. Первые носители, скорее всего, жили в районах развитого сапожного или кожевенного промысла — например, в Тверской, Костромской или Нижегородской губерниях, где вощение ниток было обычным делом.

Известных исторических личностей с этой фамилией не зафиксировано, что подтверждает её узкопрофессиональное и локальное бытование. Фамилия не перешла в дворянские роды и не попала в списки знати — это типичная фамилия мастерового человека, возможно, крепостного или посадского. Сегодня Вощеникины встречаются единично, преимущественно в центральной России и на Урале, куда могли переселиться ремесленники в XVIII–XIX веках.