Фамилия Вотчина — редкий случай, когда прозвище или термин стали родовым именем без изменений, без суффиксов -ов или -ин. Она не «притянула» к себе типичное окончание, а застыла в исходной форме, что само по себе указывает на её нестандартное происхождение. Чаще всего такие «голые» фамилии встречались на Украине или в Белоруссии, а в России — у выходцев из духовного сословия или у крестьян, получивших прозвище, которое закрепилось в документах как есть.

Слово «вотчина» в Древней Руси означало наследственное земельное владение, которое передавалось от отца к сыну (отсюда и корень). В XVI–XVII веках вотчины противопоставлялись поместьям — временным наделам за службу. Поэтому первая и самая прямая версия: фамилию мог получить владелец вотчины или управляющий вотчинным хозяйством. Однако в крестьянской среде, где фамилии начали массово закрепляться после отмены крепостного права, такое прозвище могли дать не барину, а наоборот — человеку, который вёл себя как хозяин, «вотчинник», то есть властно и независимо, или тому, кто работал на барской вотчине, например, вотчинному старосте.

Есть и менее очевидный вариант: в некоторых говорах «вотчина» могла обозначать не землю, а отчий дом, родное место. Прозвище Вотчина могли дать пришлому человеку, который тосковал по дому или постоянно вспоминал свою «вотчину» — родину. В пользу этой версии говорит то, что фамилия встречается в северных и центральных губерниях, где переселенцы из других мест часто получали прозвища по месту выхода.

С точки зрения словообразования, фамилия Вотчина уникальна тем, что она — субстантивированное прилагательное женского рода в форме именительного падежа. Такие фамилии (например, Родина, Надежда) обычно получали дети-подкидыши или люди, чьё происхождение было неясно. Но в данном случае скорее сработала модель прозвища, которое просто записали в метрику без изменений. Это делает фамилию очень локальной и редкой — в современных справочниках она практически не встречается массово, а её носители, скорее всего, происходят из одного небольшого региона.

Сравните с однокоренными фамилиями: Вотчинников, Вотчинов — они образованы стандартным способом и встречаются чаще. Вотчина же — архаичная форма, сохранившаяся, вероятно, в среде, где фамилии оформляли «на слух», без вмешательства грамотеев, которые добавили бы суффикс. Если ваши предки носили эту фамилию, стоит искать их корни в документах XVIII–XIX веков среди государственных или монастырских крестьян, реже — среди однодворцев.