Фамилия Войтенкова — женская форма фамилии Войтенков, а та в свою очередь образована от прозвища Войт. В старину, особенно на Юге и Западе Руси, войтом называли городского главу, а позднее — посадского старшину или деревенского старосту. Существовала даже поговорка: «Не бывать бабе войтом». Скорее всего, предок Войтенковых занимал одну из таких выборных должностей.

Разберём словообразовательную цепочку. Основа — Войт, к ней добавился украинский или белорусский суффикс -енк(о), который указывал на потомка или принадлежность: Войтенко — «сын Войта» или «человек из рода Войта». Когда носители такой фамилии оказывались в великорусской среде, фамилию русифицировали, добавляя типичный русский суффикс -ов. Так Войтенко превратилось в Войтенков, а от него образовалась и женская форма Войтенкова.

Есть и альтернативное объяснение основы. Слово «войтюк» в некоторых говорах означало «воин». По этой версии, прозвище могло закрепиться за человеком военным, а не за старостой. Но первая версия — с должностным прозвищем — выглядит убедительнее, поскольку «войт» как административный термин был широко распространён в документах Речи Посполитой и хорошо задокументирован. Фамилия Войтенкова, таким образом, хранит память не столько о военной службе, сколько о местном самоуправлении — о сельском или городском старшине, которого выбирали общиной.