Фамилия Войтешенюк — редкий пример западнорусской модели образования, в которой польский суффикс -юк наложился на белорусскую почву. В ней сразу три характерные черты: основа от имени Войтех, суффикс -ен- (указывающий на прямое родство) и уменьшительно-притяжательный -юк. Если разобрать по частям, получается: «сын Войтешеня», а Войтешень — это ласкательная форма от Войтех.

Имя Войтех (чеш. Vojtěch, пол. Wojciech) пришло на восточнославянские земли через католическую традицию и польское влияние. В переводе со старославянского компонентов vojь (воин) и těcha (утешение) оно означает «утешение войска» или «тот, кто радует воинов». В Беларуси и на Украине имя адаптировалось в народные формы — Войтеш, Войтешко, а от них уже пошли фамилии. Войтешенюк — типично для региона Полесья, где польские и украинские суффиксы смешивались с белорусскими говорами.

Суффикс -юк в восточнославянской ономастике обычно обозначает потомка или принадлежность к роду (ср. Ивасюк, Ковальчук). Но здесь перед ним стоит -ен-, который часто встречается в белорусских фамилиях от имён на -ш: Войтеш → Войтешеня → Войтешенюк. Такая цепочка говорит о том, что предок носителя фамилии был сыном человека по прозвищу Войтешень — скорее всего, невысокого роста или молодого, раз использована уменьшительная форма.

Географически фамилия Войтешенюк почти не встречается за пределами западной Беларуси и приграничных районов Польши. В российских переписях XIX века её нет — это говорит о том, что носители либо оставались в черте оседлости, либо эмигрировали поздно. Сословно предки, скорее всего, были крестьянами или мещанами униатского вероисповедания, поскольку имя Войтех у православных почти не употреблялось.

Если сравнивать с однокоренными фамилиями — Войтехович, Войцеховский, Войтешко — то Войтешенюк стоит особняком как самая «домашняя» форма. В ней нет пафоса польского -ский, нет архаики -ович, есть только прямое указание на родство с конкретным человеком, которого в семье звали ласково.