Фамилия Вырекин — редкий пример, где корень угадывается не сразу. На слух она напоминает топонимические фамилии вроде Вырецкий или Вырский, но суффикс -ин указывает на иную модель: так образовывали фамилии от личных прозвищ или названий профессий, оканчивающихся на -а/-я. Основа здесь — «Вырека», а не «выр-» с добавлением суффикса.

Прозвище Вырека могло возникнуть от глагола «вырекать» в старом значении «высказывать, произносить вслух, объявлять». В северных и сибирских говорах «вырекать» означало «отрекаться, отказываться», а иногда — «выговаривать, упрекать». Человека с острым языком, любителя поучать или, наоборот, того, кто отрёкся от какого-то обязательства, могли прозвать Вырекой. Фамилия закрепилась за его потомками.

Менее вероятная, но возможная версия — связь с диалектным словом «вырок» (выкидыш, нежизнеспособный детёныш). В этом случае прозвище могли дать слабому, болезненному ребёнку, но такой корень редок и обычно не даёт производных на -ека. Поэтому основная гипотеза — прозвище по речевому поведению.

Фамилия Вырекин почти не встречается в центральных областях России. Больше всего носителей зафиксировано в Кировской области и на Урале — в зоне позднего заселения, куда переселенцы приносили севернорусские говоры. Именно там глагол «вырекать» сохранялся дольше всего. В документах XVIII–XIX веков фамилия могла писаться через «ѣ» — Вырѣкин, что подтверждает связь с древним корнем «рек-» (говорить), а не с современным «рыть» или «вырывать».

Сословная принадлежность предков Вырекиных — почти наверняка государственные крестьяне или однодворцы. Дворянских родов с такой фамилией не зафиксировано. В XIX веке встречаются единичные записи о Вырекиных среди крестьян Вятской губернии и мещан Перми.