Фамилия Варекин — одна из тех, где этимология не лежит на поверхности, а заставляет заглянуть в словари диалектов и старых прозвищ. Она образована по самой распространённой русской модели: от основы Варек- с помощью патронимического суффикса -ин. Суффикс указывает на принадлежность («чей?») — значит, предка звали Варека.

Кто же такой Варека? Здесь есть две основные версии, и обе уходят корнями в народную речь.

Первая и самая вероятная связывает прозвище с диалектным словом «варе́га» (или «варежка»). В северных и центральных говорах так называли не только рукавицу, но и человека с толстыми, неуклюжими руками, а иногда — того, кто часто их потирал или держал за пазухой. Прозвище могло быть шутливым, но беззлобным. Модель «вещь → человек» в русских фамилиях встречается постоянно: Шапкин, Лаптев, Варекин — один ряд. Поддерживает эту версию и то, что в старых переписных книгах XVII века фиксируются люди с прозванием Варега, Варежко.

Вторая версия — менее очевидная, но тоже возможная. Варека могло быть производной формой от крестильного имени Варфоломей (через усечение и переосмысление: Варя → Варька → Варека). Однако для Варфоломея типичнее уменьшительные Варя, Варюха, Варфоломейка. Форма с твёрдым -р- и суффиксом -ек- встречается реже, поэтому этот путь менее надёжен.

Географически фамилия Варекин тяготеет к северо-востоку России: она встречается в старых метрических книгах Вятской, Пермской, Костромской губерний. Это косвенно подтверждает «северную» природу слова «варега». На юге и западе России фамилия почти не фиксируется.

В написании фамилии стоит обратить внимание на букву е в корне. Если бы предка звали Варя (от Варвара или Варфоломей), фамилия писалась бы через «я» — Варякин. Сохранение «е» указывает именно на связь с «варегой», а не с личным именем.

Таким образом, скорее всего, первый носитель фамилии Варекин получил прозвище по характерной черте внешности или одежды — либо за большие руки, либо за привычку носить варежки. Это не дворянская фамилия, а крестьянская или посадская, каких тысячи в русской истории.