Фамилия Высоковская — характерный пример «географической» фамилии, образованной по модели, типичной для польской и западнорусской шляхты, а затем и для духовенства. В её основе лежит название населённого пункта с корнем «высок-»: Высокое, Высоково или Высоков. Таких сёл и деревень в России, Беларуси и Украине десятки, поэтому точную «малую родину» предка, первым получившего эту фамилию, установить без генеалогического поиска почти невозможно.

Суффикс -ск- указывает на то, что фамилия первоначально отвечала на вопрос «откуда?» или «чей?». В среде дворянства и духовенства (особенно в XVII–XIX веках) такие фамилии давались по названию поместья или места служения. Священник, служивший в храме в селе Высоково, мог получить фамилию Высоковский, а его дочь или вдова — Высоковская. В крестьянской среде эта фамилия встречается реже, так как у крепостных крестьян фамилии на -ский часто были «искусственными», данными помещиком или записанными при переписи по названию деревни.

Сама основа «высок-» восходит к древнерусскому прилагательному «высокий», которое в топонимике означало не только физическую высоту (холм, возвышенность), но и «верхний» по течению реки, а также «главный» или «знатный» в переносном смысле. В ойконимике (науке о названиях поселений) «Высокое» — одно из самых распространённых названий, что объясняет широкую географию фамилии: от Смоленщины до Сибири.

Интересная деталь: в старых документах фамилия могла писаться через «о» — Высоковская, или через «а» — Высокавская, в зависимости от местного акающего говора. Встречается и вариант Высоцкая — однокоренная, но с другим суффиксом, указывающим на тот же корень «высок-», но через чередование «к/ц». Однако Высоковская — форма более прозрачная и прямо указывает на «Высоково» или «Высоков», а не на «Высоцк».

Таким образом, носительница фамилии Высоковская может с большой вероятностью считать, что её предки происходили из одного из многочисленных селений с «высоким» названием, а сама фамилия закрепилась за ними как указание на место жительства или владения землёй.