Фамилия Ячкина — женская форма фамилии Ячкин, и её происхождение напрямую связано с мужским прозвищем или именем Ячка. В основе лежит суффикс -ин, который в русской ономастике указывает на принадлежность: Ячкин — это «сын Ячки» или «человек из рода Ячки». Такая модель типична для центральной и северной Руси, где фамилии на -ин образовывались от основ, оканчивающихся на -а или -я.

Самая вероятная версия происхождения корня — от уменьшительной формы имени Яков. В народной речи имя Яков сокращалось до Яша, а далее, через диалектные варианты, могло превратиться в Ячка (по аналогии с Ваня — Вачка, Петя — Печка). Таким образом, Ячка — это ласкательное или обиходное прозвище Якова. Менее распространённая гипотеза связывает фамилию с диалектным словом «ячка» — так в некоторых говорах называли ячменную крупу или кашу из неё. В этом случае прозвище мог получить либо крестьянин, сеявший ячмень, либо любитель ячневой каши. Однако лингвистически версия с именем Яков выглядит убедительнее, так как суффикс -к- в русских прозвищах чаще образует уменьшительные формы личных имён, а не названия продуктов.

Фамилия сравнительно редкая, её география тяготеет к Поволжью и центральным областям России. Встречаются также однокоренные варианты: Ячков, Ячкинский, Ячменёв (последний уже от слова «ячмень»). Что касается социального контекста, то носители фамилии Ячкин (и Ячкина) в XIX веке чаще всего были крестьянами или мещанами — дворянских родов с такой фамилией в родословных книгах не зафиксировано. Ударение в фамилии традиционно падает на первый слог: Ячкина.