Фамилия Ягодицына — женская форма фамилии Ягодицын. В её основе лежит прозвище или нецерковное имя Ягодица. В русской ономастике слова с корнем «ягод-» обычно связывают либо с ягодами, либо с уменьшительно-ласкательными формами личных имён. В случае с Ягодицей есть два основных объяснения, и оба вполне жизненны.

Первая версия — прозвище по внешности или характеру. В народных говорах «ягодица» могла означать не только часть тела, но и «румяную, красивую девушку» или, напротив, «изнеженного, холёного человека». Прозвища по частям тела («Лоб», «Щека», «Губа») в древнерусской антропонимии встречались, но редко, и обычно имели переносный смысл. Так что Ягодицей могли назвать человека с круглым румяным лицом — по ассоциации с наливной ягодой.

Вторая версия — происхождение от канонического имени Агафодор (греч. «благой дар») через его народные формы. В русском языке имя Агафодор упрощалось до Агафон, а затем в некоторых диалектах давало уменьшительные варианты вроде Ягодка, Ягодица. Подобные трансформации известны: имя Агапия превращалось в Ягапа и даже в Ягоду. Если это так, то Ягодицын — потомок человека, которого в крещении назвали Агафодором или Агафоном.

Суффикс «-ин» указывает на принадлежность: «чей?» — Ягодицын, то есть сын или дочь Ягодицы. Такая модель типична для северных и центральных областей России, где фамилии на «-ин» образовывались от слов, оканчивающихся на «-а» или «-я». В южных и восточных регионах чаще встречается суффикс «-ов».

Географически фамилия Ягодицын (и Ягодицына) встречается рассеянно, без ярко выраженного гнезда. Наибольшая концентрация — в Вологодской, Костромской и Кировской областях, что косвенно подтверждает севернорусское происхождение. В этих краях фамилии на «-ин» от прозвищ — обычное дело.

Интересно, что у фамилии Ягодицын есть редкий вариант написания через «о» — Ягодицын (от «ягодица»), а не «Ягодицын» (от «ягодка»). Это говорит о том, что прозвище было именно Ягодица, а не Ягодка. В документах XVII–XVIII веков можно встретить крестьян Ягодицыных в Тотемском уезде, что подкрепляет версию о прозвищном происхождении.

Таким образом, носительница фамилии Ягодицына может считать себя потомком либо румяного и статного человека, прозванного Ягодицей, либо крещёного Агафоном, чьё имя в быту сократили до ласкового Ягодица. Оба варианта не противоречат друг другу и ведут в одну и ту же эпоху — в XVI–XVII века, когда фамилии только закреплялись за русскими семьями.