Фамилия Яковинова — женская форма от Яковинов, и её разумнее всего разбирать через мужской вариант. Основа здесь — имя Яков, одно из самых распространённых в русском крестьянском и мещанском быту. Но ключевая особенность — не сам корень, а редкий и показательный суффикс -инов. В русских фамилиях есть две похожие, но разные модели: -ов (прямое указание на отца: Яковлев — сын Якова) и -ин (принадлежность матери или прозвищу: Яковин — «чей?» — Яковин сын). Яковинов — это уже вторая ступень: фамилию образовали не от имени Яков, а от более ранней фамилии или прозвища Яковин. То есть предок носителя мог быть не просто Яковом, а Яковом, которого в деревне звали Яковин (возможно, по матери, если она была Якова, или по характерному признаку). А его дети уже стали Яковиновыми — «из рода Яковиных». Такая модель встречается реже, чем прямые отчества, и часто указывает на более позднее оформление фамилии, когда в семье уже закрепилось прозвище, а не имя отца.

По географии фамилия Яковинова не имеет ярко выраженного «гнезда», как, скажем, типичные северные или южные фамилии. Встречается разрозненно, но чаще — в центральных и южнорусских областях, где имя Яков было особенно популярно. В дореволюционных переписях и метрических книгах Яковиновы — это в основном государственные крестьяне и мещане, реже — однодворцы. Дворянских родов с такой фамилией не зафиксировано, что подтверждает её «низовое», народное происхождение. С точки зрения словообразования, фамилия стоит в одном ряду с такими же двойными суффиксальными образованиями, как Маркинов, Степанинов, Васькинов — все они говорят о том, что прозвище или полуотчество успело закрепиться до того, как семья получила постоянную фамилию.

Спорных версий здесь практически нет: корень и суффикс прослеживаются однозначно. Единственное, что может сбить с толку, — попытка связать фамилию с названием города Яковин или с неким «яковином» как видом орудия или растения. Никаких подтверждений таким гипотезам нет: ни в словарях русских говоров, ни в ономастических справочниках подобные значения не зафиксированы. Фамилия остаётся в кругу канонических личных имён, без экзотических корней. Так что для носителя фамилии Яковинова ответ прост: ваши предки — потомки человека по прозвищу Яковин, которое, в свою очередь, пошло либо от имени Яков, либо от женщины Яковы.